CAS D'ESTUDI
L’objectiu general del projecte és ensenyar com s’aborda l’estudi del control genètic d’un caràcter qualitatiu, d’una banda emprant mètodes de genètica clàssica (inferència del control genètic a partir de les desviacions entre la segregació observada i l’esperada) i de l’altra arribant a conéixer la seqüència del gen responsable del caràcter mitjançant l'ús d'eines de la biologia molecular.
Com a cas d’estudi es proposa el control genètic de la forma de la fulla de la tomaquera (Solanum lycopersicum). S’han generat poblacions segregants per aquest caràcter (F1, F2 i retroencreuaments) que estan a disposició de l’alumnat. D’altra banda, al laboratori de biologia molecular a partir del material vegetal fenotipat pels propis alumnes s'arribarà a obtenir la seqüència nucleotídica del gen responsable d'aquest caràcter.
LA TOMAQUERA, UNA ESPÈCIE MODEL PELS ESTUDIS DE BIOLOGIA MOLECULAR I D'HERÈNCIA
La tomaquera (Solanum lycopersicum) és considerada una planta model per a l’estudi d’espècies que produeixen fruits climatèrics. És una espècie diploide excel·lent per a la investigació per diferents motius: la facilitat per cultivar-la en ambients molt diversos, el cicle de cultiu curt i no sensible al fotoperíode, un elevat grau d’autofecundació i d’homozigosi, la facilitat per realitzar hibridacions controlades, el fet de ser una de les espècies diploides amb el genoma més petit, la possibilitat de realitzar multiplicació asexual i de regenerar la planta sencera, l’accés a un ampli número de mutants i d’estocs genètics i el seu genoma completament seqüenciat.
Podeu veure la diversitat genètica que existeix en aquesta espècie entrant a:
LA FORMA DE LA FULLA DE LA TOMAQUERA COM A MODEL D'ESTUDI:
S’ha escollit treballar amb un mutant corresponent al gen Solyc06g074910 o gen C, ja que presenta un fenotip de fulles menys serrades (anomenat fulla de patata) que les plantes silvestres, de fàcil identificació i observable a l’estadi de plàntula.
Fenotip silvestre
Fenotip fulla de patata
L'anàlisi de la seqüència del gen C ens permet determinar la mutació responsable del fenotip fulla de patata. És a dir, seleccionar les plantes segons el seu genotip.
Seqüència genòmica silvestre del gen Solyc06g074910:
ATGGGAAGAGCTCCTTGTTGTGATAAGAATAATGTTAAAAGAGGGCCATGGTCACCAGAAGAAGATGCTAAGCTTAAAGAATTCATTGAAAAATATGGAACTGGTGGTAATTGGATTGCTCTTCCTCTAAAAGCTGGTAAGTTTAGTCGAACTCAGTAACTTATAGTTCAAACCTTTTGTATTTATTTTAGAAAATTCACTTAATATATGTACATCCAATAATATAACAACAACAATATGTATAGTGTAATTTCATGAATAAGTTAAACGAGGATAGGATGTTATATGCAGATGTTACTCCTACAAATGTTGAGTAGAAAAGTATAAACCCTTAGATTCAAAAGAAAGGAAGAATTTTGAAATTAGACAATAAAATATCAGGTTACAAAGCAAATGAAGCAATAAACAATAGTAATAAACACTAAAGAAAAAGAAATAACAAAGAGTACGTTCGAAATTTTTAGAACCAATAAAGTTCAAATCTTGACCATAAAAAGTATTTCTTTTATATTTTCTATTTATATAATTTGATGAGATTATGGTTTTAAATCAGGATTAAAGAGATGTGGAAAGAGCTGCAGATTAAGATGGCTAAATTATCTAAGGCCAAATATAAAGCATGGTGATTTTTCTGATGAAGAAGATAGGGTAATATGCAGTTTATATGCCAGCATTGGGAGCAGGTGACAAACTTTTTAATTAAGTCAAAATTATTTAACAGTTTTTCCTCTCTTTTTTTTTTCCTGTTTTGGTCACTAATTATCTACCACTACCTTCATTTTACCTTCAATTTCTTCACTCATCATGTATTTGCATATGACTTTTGAGACAAAAGTAAATCCCATAAATTTTAAAAAAAGAAATTGAAAGAAGAACTTCAATGGTGTAGAAAATAAATATTAATTAAGACTCAAAGAAAAGTAATAATTTAATTTTGTTGGGTTCTGACTGAAGATTCTACAATTTTTATGGATATTTCATCTGCATGCATGCCAGTTTTAGATCTTGGATCAAGTCCTTAATTACAGCTGTTAGGACACAGTCCATAAAATGTAAAACTATTCTAAGTTTCTTGATAAAACAACTTATGTATAGCACCTACGGTTAGATTTCTCTAAAACAATATTTATTATTACAGTCAAGATAATTTGAAATCAATTTTCCATGTTTATAACAATACTTTGCTAAAACAACTAAAATATATCCAAACAAACAATTTTATTATAAAAATATTTAACTATATATCTTATCAATTTGAGTTTAAATTTTCTATGACATGTAACTTTTTTGTAACAAGTTTGATATACTTAAAAGTTGATTAAATTGAATAATAAACATCTATAGATGGTTAAATCAAATTTTAAAATGCCAAATTATTTATATGTTGAATATATATTATAACGTAAATGATGTTGTACATTTATACAGGTGGTCAATTATAGCAGCTCAGTTACCAGGGAGGACCGACAATGATATTAAAAACTATTGGAACACAAAGCTTAAGAAGAAGCTCATGGGTTTTATTCAGTCATCATCTAATATTAACCAGAGAACTAAATCACCTAATTTATTATTCCCTCCTACAAGTACTCTTCAAACAACTTTTCAATCCCAATCTCAAGCATCAATTTCAAATCTTTTAAGAGATTCATATGTAGAGCCCATTCCACTAGTCCAACCAAATTTCATGTACAACAACAATAACATGATGAACTTTCAATTAGGTACAAATAATCAACATTCTTATAATTTTCATGATCAAAGCTTAATGAATCCCATGCAAACAATTAGTTCTTGTTCTTCATCTGATGGTCTAAGTTGCAAACAAATTAGCTATGGCAATGAGGAAATGATGTGTCAAATTCCTTTTGAAGAAACCCAAAAGTTTACACTTGACAATTATTGTACTACTTGGGCTGATCATCAAAAGACAAATGGATATTTTGGGAATAACTTTCAAAGTAGTCAATTCCAGTATGATGATCATACTAATATTGAAGAAATTAAGGAGTTGATTAGTAGTAGCTCTAGTAATGGCAATGGATGTAACAATGTAGGGTACTGGGGTTAATTTTAATTTTATTTTGTAGGTGTGAGTACTTGTAAGTTTTAATGAAATTTATTCATGGAAAGCTTTTATTTTGCTTCCACTGAATTAGGA
Podeu veure la informació genètica que existeix sobre aquesta espècie entrant a: